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不同點(diǎn)：
一、流動(dòng)相不同：HPLC為液體流動(dòng)相，GC為永久性氣體作流動(dòng)相（通常叫做載氣）
二、進(jìn)樣器不同：高效液相為平頭進(jìn)樣針，氣相色譜為尖頭進(jìn)樣針
三、色譜柱長(zhǎng)不同：
（1）氣相色譜柱通常幾米到幾十米
（氣相色譜由于載氣的相對(duì)分析量較低，分子間隙大，故粘度低，流動(dòng)性好，組分在氣相中流動(dòng)速度快，因此可以增加柱長(zhǎng)，以提高柱效）。
（2）液相色譜柱通常為幾十到幾百毫米
四、分析種類有差異：
氣相色譜分析的對(duì)象多為（不適絕對(duì)）：分子質(zhì)量小于1000，低沸點(diǎn)，易揮發(fā)，熱穩(wěn)定性好的化合物。
液相色譜：更適用于分析高沸點(diǎn)，難揮發(fā)，熱穩(wěn)定性差，分子質(zhì)量較大（1000 - -2000）的液體化合物。
五：樣品柱前變化不同：氣相色譜的樣品在柱前必須變?yōu)闅怏w（氣化室汽化），而液相色譜的樣品在柱前則無(wú)變化。
六、所用檢測(cè)器有差異：
液相主要為：紫外檢測(cè)器，熒光檢測(cè)器、示差折光檢測(cè)器.....
氣相色譜主要為：氫火焰離子化檢測(cè)器（FID）,熱導(dǎo)檢測(cè)器（TCD）,電子捕獲檢測(cè)器（ECD）,火焰光度檢測(cè)器（FPD）,氮磷檢測(cè)器（NPD）.....
相同點(diǎn)：基本原理相同。
都是利用物質(zhì)在流動(dòng)相和固定相中的分配系數(shù)的差別，從而在兩相間反復(fù)多次（1000-1000000次，甚至更多）的分配，使原來(lái)分配系數(shù)差別很小的各組分分離開(kāi)來(lái)。